Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actg1P63260 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms