Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms