Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3P62908 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms