Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms