Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rps29P62274 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms