Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms