Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Depdc5P61460 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Depdc5P61460 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms