Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms