Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf1P61148 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf1P61148 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms