Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ActbP60710 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ActbP60710 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ActbP60710 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms