Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms