Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33bP59016 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps33bP59016 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms