Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P58686 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P58686 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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P58686 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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P58686 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P58686 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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P58686 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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P58686 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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P58686 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P58686 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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P58686 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P58686 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P58686 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P58686 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P58686 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P58686 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P58686 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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