Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr8P58682 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr8P58682 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms