Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf16P58334 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms