Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms