Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm9sf2P58021 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms