Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpa1P57784 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpa1P57784 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms