Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtnsP57757 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms