Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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