Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd3P55096 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms