Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Faf1P54731 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Faf1P54731 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms