Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms