Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k1P53349 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms