Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms