Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx3P50481 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx3P50481 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms