Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cav1P49817 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cav1P49817 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms