Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmod1P49813 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod1P49813 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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