Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms