Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CitP49025 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CitP49025 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CitP49025 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CitP49025 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CitP49025 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CitP49025 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CitP49025 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CitP49025 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CitP49025 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms