Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms