Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GdnfP48540 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms