Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gli1P47806 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms