Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrprbP47758 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms