Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms