Protein–RNA interactions for Protein: P43346

Dck, Deoxycytidine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DckP43346 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DckP43346 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DckP43346 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
DckP43346 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DckP43346 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DckP43346 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DckP43346 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DckP43346 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DckP43346 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms