Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlx1P43345 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms