Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx1-2P42580 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx1-2P42580 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx1-2P42580 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx1-2P42580 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms