Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms