Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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