Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbP41155 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LtbP41155 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbP41155 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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