Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox7P40646 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox7P40646 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms