Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms