Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col18a1P39061 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms