Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TtlP38585 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TtlP38585 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TtlP38585 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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TtlP38585 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TtlP38585 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TtlP38585 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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TtlP38585 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtlP38585 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtlP38585 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TtlP38585 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TtlP38585 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtlP38585 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms