Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms