Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpargP37238 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpargP37238 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpargP37238 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpargP37238 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpargP37238 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpargP37238 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpargP37238 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpargP37238 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpargP37238 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms