Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprkP35822 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms