Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2aP35436 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2aP35436 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2aP35436 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2aP35436 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2aP35436 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Grin2aP35436 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2aP35436 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2aP35436 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Grin2aP35436 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2aP35436 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Grin2aP35436 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2aP35436 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms