Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms